NEP Dataset Display

NEP Dataset Display 是用来查看、筛选和导出结构数据的页面。它有两类常见用途：

• DFT 之前：把 Make Dataset 生成的候选结构导入进来，先删掉明显异常结构，再采样去 DFT。

• 训练之后：导入训练结构和模型输出，找误差大的结构，判断下一轮数据应该补哪里。

它不是训练器，也不替代 DFT。这里的重点是把结构和图上的异常点连起来，让你能快速决定： 保留、删除、导出，还是回到上游重新生成。

数据从哪里来

可以导入三类数据：

输入	什么时候用	你会看到什么
候选结构 xyz / extxyz	Make Dataset 刚生成结构后	结构视图、组成、标签、预测或几何异常
训练结构 + nep.txt	想用模型快速预筛或回看预测	能量、力、应力等预测结果
训练输出目录	GPUMD 训练结束后	预测-标签散点、误差最大结构、可导出的子集

入口是顶部 Open。如果只是看一批候选结构，直接打开 xyz 文件；如果要回看完整训练结果， 打开包含训练输出的目录或对应文件。

第一次应该看哪里

先看三个区域：

1. 误差图或分布图：先找离群点，不要一上来逐个翻结构。

2. 结构视图：点中图上的结构后，看右侧是否有过近原子、不合理配位、奇怪表面或异常磁矩。

3. 状态行：关注 Orig / Now / Rm / Sel / Unsel / Rej，确认当前删掉、选中和保留的数量。

如果你正在处理 Make Dataset 的候选结构，建议先看完整流程： 候选结构清洗后再进入 DFT。

按目的选工具

目的	推荐入口	结果
找最极端的异常点	Find Max Error Point	选中误差最大的前 N 个结构
按图上范围选一批点	Select by Range	选中落在指定坐标范围内的结构
找过近原子或疑似坏构型	Finding non-physical structures	选中疑似非物理结构
检查净力是否异常	Check Net Force	选中净力超过阈值的结构
按来源筛结构	搜索框 tag 模式	按 Config_type 找某类生成结构
按元素筛结构	搜索框 elements 模式	找含有或不含某些元素的结构
删除当前选中结构	Delete Selected Items	从当前数据集中移除选中结构
后悔删除	Undo	恢复最近一次删除
导出干净子集	顶部 Save / 导出菜单	保存后进入 DFT、FPS 或训练流程

如果你不知道按钮图标对应哪个功能，查 Show NEP 详细参考。参考页按按钮列出了弹窗参数和执行结果。

候选结构清洗时怎么用

候选结构清洗的重点不是追求预测精度，而是先剔除明显坏样本：

1. 打开 Make Dataset 导出的候选结构。

2. 用结构视图和 Finding non-physical structures 找几何异常。

3. 如果有可用 NEP 模型，再看预测力、能量或分布长尾。

4. 选中异常结构后删除，或单独导出做记录。

5. 导出清洗后的候选池，再做 FPS 或其他代表性采样。

这里要避免一个顺序错误：不要把未清洗的候选池直接交给 FPS。FPS 只看描述符距离， 坏结构可能因为“离得远”被选中。

训练结果回看时怎么用

训练结束后，这个页面更像诊断台：

1. 打开训练输出。

2. 先看 energy / force / stress / virial 的散点图。

3. 用 Find Max Error Point 找误差最大的结构。

4. 在右侧查看结构和 Config_type，判断误差来源。

5. 导出这些结构，作为下一轮补数据或排查 DFT 标签的入口。

判断时不要只看一个总 RMSE。更有用的是确认误差集中在哪类结构： 缺陷、表面、应变、高能构型、某个元素组合，还是某个生成卡片的输出。

搜索模式

• tag：基于 Config_type 正则匹配。

• formula：基于化学式正则匹配。

• elements：元素集合语法，例如 +Fe -O。

• expression：基于结构级表达式筛选，支持 natoms、元素统计、能量、力、应力、virial 和 atomic.<name>。

expression 的完整语法、字段规则和示例见 Show NEP 详细参考。